O Conselho Científico é composto pelo Presidente e por catorze membros, assim distribuídos:
a) 12 representantes eleitos pelos professores e investigadores de carreira e restantes docentes e investigadores em regime de tempo integral, com contrato de duração não inferior a um ano, que sejam titulares do grau de doutor, qualquer que seja a natureza do seu vínculo ao Instituto;
b) 2 representantes da Unidade de Investigação e Desenvolvimento em Educação e Formação.
O mandato dos membros do Conselho Científico é de quatro anos, renovável, mediante eleição, sendo que os mandatos consecutivos do Presidente do Conselho Científico não podem exceder oito anos.
As principais competências do Conselho Científico são:
Relativamente a provas académicas e pessoal de investigação, compete ao Conselho Científico:
O Conselho Científico reúne ordinariamente uma vez por mês e, extraordinariamente, por convocação do Presidente ou de um terço dos seus membros.
Membros efetivos
Luis Miguel de Figueiredo Silva de Carvalho (Presidente)
João Pedro Mendes da Ponte
Justino Pereira de Magalhães
João Filipe Lacerda Matos
Cecília Galvão Couto
Feliciano Henriques Veiga
Domingos Manuel Barros Femandes
Ana Paula Viana Caetano
Jorge Manuel Nunes Ramos do Ó
Maria Leonor de Almeida Domingues dos Santos
Maria Natália de Carvalho Alves
Estela Mafalda Inês Elias Fernandes da Costa
Hélia Margarida Aparício de Oliveira
Membros suplentes
Cármen de Jesus Dores Cavaco
Maria João Mogarro
Fernando António Albuquerque Costa
Maria Luísa Machado Cerdeira
Maria Isabel Seixas da Cunha Chagas
Ana Isabel da Câmara Dias Madeira
Carolina Fernandes de Carvalho
Maria Benedita de Lemos Portugal e Melo
Florbela Luis de Sousa
Gilda Maria de Carvalho Fernandes Soromenho Pereira
Membros efetivos
Pedro Guilherme Rocha dos Reis
Luís Alexandre da Fonseca Tinoca
Membros suplentes
Ana Sofia Alves da Silva Cardoso Viseu
Ana Sofia Martins Silva Freire dos Santos Raposo